Als unabhängige Organisation, die sich der freien Wissenschaft verpflichtet hat, finanziert sich das KML durch die Beiträge der ordentlichen Mitglieder sowie einer stetig zunehmenden Zahl an Fördermitgliedern und Spendern. Darüber hinaus gibt es einzelne Projekte, die durch Kooperationen mit Stiftungen, Krankenkassen, der Patientenselbsthilfe, der Industrie und der Universität zu Köln zustande kommen. Alle Projekte und Aufgabenbereiche des KML verfolgen dabei ein Ziel: nämlich die Arbeit der deutschen Lymphom-Forschungsgruppen zu unterstützen und ihre Erkenntnisse schnellstmöglich zu den Patienten und ihren behandelnden Ärzten zu bringen.
Zuwendungen Dritter dürfen nicht dazu geeignet sein, die Unabhängigkeit des KML zu beeinträchtigen oder die Handlungen des KML zu beeinflussen. Die jeweiligen Förderer werden individuell und projektbezogen genannt.